มีอาณาเขตติดต่อกับ
ทิศเหนือ จด ประเทศลาว ตำบลห้วยสะแตง อำเภอเมืองเงิน หลวงพระบาง
ทิศใต้ จด เขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าดอยผาช้าง ตำบลผาช้างน้อย อำเภอปง จังหวัดพะเยา
ทิศตะวันออก จด ป่าสงวนแห่งชาติป่าน้ำยาว และป่าน้ำสวด ตำบลชนแดน อำเภอสองแคว จังหวัดน่าน
ทิศตะวันตก จด ป่าสงวนแห่งชาติป่าน้ำเปื๋อย น้ำหย่วนและน้ำลาว อำเภอเชียงคำ จังหวัดพะเยา

เส้นทางคมนาคม ระยะทางจากจังหวัดน่าน ถึงอำเภอสองแคว ประมาณ 75 กิโลเมตร และระยะทางจากอำเภอสองแคว ถึงสำนักงานถ้ำสะเกิน 38 กิโลเมตร เป็นถนนลาดยางตลอดเส้นทาง

อุทยานแห่งชาติถ้ำสะเกิน มีศูนย์บริการนักท่องเที่ยว มีเจ้าหน้าที่ประจำในการติดต่อสอบถามให้รายละเอียดเกี่ยวกับอุทยานแห่งชาติ และการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ ทางอุทยานฯ มีบ้านพักจำนวน 1 หลัง สามารถพักได้ 30 คน และมีสถานที่กางเต้นท์ จำนวน 1 แห่ง พักได้ทั้งหมด 50 - 100 คน และร้านสวัสดิการอุทยานฯ บริการอาหาร เครื่องดื่ม สนใจติดต่อได้ที่ทำการอุทยานแห่งชาติถ้ำสะเกิน ตู้ปณ.18 อำเภอท่าวังผา จังหวัดน่าน 55000 โทร. (054) 779094 หรือติดต่อสอบถามได้ที่งานบริการบ้านพัก ฝ่ายนันทนาการและสื่อความหมาย ส่วนอุทยานแห่งชาติ สำนักอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ กรมป่าไม้ กรุงเทพฯ โทร.5797223 , 5795734 หรือ โทร.5614292 - 4 ต่อ 724 , 725

มีลักษณะเป็นเทือกเขาสลับซับซ้อน วางตัวในแนวเหนือใต้ เนื่องจากเป็นปลายเขาผีปันน้ำตะวันออก ทอดตัวลงมาจากประเทศลาว สูงจากระดับน้ำทะเลประมาณ 400 - 1,752 เมตร เป็นพื้นที่ที่มีความลาดชันสูง มีที่ราบเฉพาะบนสันเขา มีแหล่งน้ำอุปโภคบริโภค คือ น้ำประปาภูเขา และมีอ่างเก็บน้ำบ้านสะเกิน 1 แห่ง

สัตว์ป่าที่อาศัยอยู่ในอุทยานแห่งชาติถ้ำสะเกินเป็นจำนวนมาก ได้แก่ หมูป่า เก้ง กวาง ลิง และเลียงผา และสัตว์ที่นับว่าเป็นจุดเด่น ได้แก่ ลิง นกนางแอ่น เต่าปูลู นกแว่นสีเทา เก้ง และเลียงผา

จุดเด่นที่น่าสนใจ :

อุทยานแห่งชาติถ้ำสะเกิน เคยเป็นพื้นที่สู้รบกันระหว่างทหารอเมริกันและลาวแดง มีชนกลุ่มน้อยอาศัยอยู่มากมายหลากหลาย เช่น ชาวเขาเผ่าเย้า ม้ง ลาว และลัวะ มีพื้นที่เป็นป่าดงดิบชื้นที่มีสภาพสมบูรณ์ ไม่ถูกรบกวนมีความหลากหลายทางชีวภาพสูง และมีสัตว์ป่าหายาก เช่น เลียงผา นกแว่น และเต่าปูลู ฤดูการท่องเที่ยวจะอยู่ใน ช่วงเดือน กันยายน ถึงเดือน กุมภาพันธ์มีจุดเด่นที่น่าสนใจ ได้แก่ น้ำตกหงษ์เวียงจันทร์ น้ำตกคลองปลากั้ง น้ำตกบ้านยอด ดอยจี๋ ดอยผาช้าง ดอยยาว ถ้ำสะเกิน ถ้ำบ้านยอด ลำน้ำลาว ลำน้ำยวน ลำน้ำงิม บ่อน้ำรอนบ้านน้ำเกาะหลวง จุดชมวิวถ้ำสะเกิน จุดชมวิวสันดอยจี๋ ลานสารวิน นอกจากนี้นักท่องเที่ยวยังสามารถ ตั้งแคมป์ เดินป่า ปิคนิค ดูนก ส่องสัตว์ และกิจกรรมอื่นๆ อีกมากมาย